home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Arsenal Files 6 / The Arsenal Files 6 (Arsenal Computer).ISO / health / med9605a.zip / M9650078.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-03-09  |  2KB  |  40 lines
  1.        Document 0078
  2.  DOCN  M9650078
  3.  TI    Internal controls as performance monitors and quantitative standards in
  4.        the detection by polymerase chain reaction of herpes simplex virus and
  5.        cytomegalovirus in clinical specimens.
  6.  DT    9605
  7.  AU    Nash KA; Klein JS; Inderlied CB; Department of Pathology, Childrens
  8.        Hospital Los Angeles, CA; 90027, USA.
  9.  SO    Mol Cell Probes. 1995 Oct;9(5):347-56. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        GENBANK/U06236
  11.  AB    Internal controls (IC) were produced and characterized for an HSV and a
  12.        CMV PCR assay which serve both as test performance monitors and as
  13.        quantitative standards. In each of the PCR assays the IC and native
  14.        targets were amplified with equal efficiency and were detected with the
  15.        same sensitivity, i.e. < 10 target copies. An algorithm was developed
  16.        for the use of IC as a quantitative standard which entailed coamplifying
  17.        a test specimen with four two-fold dilutions of the respective IC target
  18.        (63-500 copies), followed by regression analysis of the relative yield
  19.        of amplification products. This approach allowed the determination of
  20.        both the initial virus genome copy number and the variability of the
  21.        results, which provided a confidence index for the PCR assay. The
  22.        relative yields of PCR products were determined by Southern blot and
  23.        probe hybridization and by densitometry of digitized ethidium
  24.        bromide-stained gels. Both methods produced estimations of the initial
  25.        target copy numbers within +/- 40% of the expected value. Such a
  26.        comprehensive analysis of an internal control for a PCR assay provides a
  27.        rigorous control of test performance and permits reliable quantitative
  28.        interpretation of a PCR assay result.
  29.  DE    Adolescence  Algorithms  AIDS-Related Opportunistic Infections/DIAGNOSIS
  30.        Base Sequence  Case Report  Child  Comparative Study
  31.        Cytomegalovirus/GENETICS/*ISOLATION & PURIF  Cytomegalovirus
  32.        Infections/DIAGNOSIS  DNA Primers  DNA, Viral/ANALYSIS/GENETICS  Herpes
  33.        Simplex/DIAGNOSIS  Herpesvirus 2, Human/GENETICS/*ISOLATION & PURIF
  34.        Human  Male  Molecular Sequence Data  Oligonucleotide Probes
  35.        *Polymerase Chain Reaction  JOURNAL ARTICLE
  36.  
  37.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  38.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  39.  
  40.